各有關單位:
根據“生態環境部南京環境科學研究所委托業務管理規定”有關要求,生態環境部南京環境科學研究所(以下簡稱“南京所”)現組織開展水體污染物環境效應評估項目全基因組甲基化測序委外業務采購申報。請有意向的單位按照下列相關要求組織申報:
一、供應商的資格要求
1. 在中華人民共和國境內注冊,具有獨立法人資格的企事業單位,有依法繳納稅收和社會保障資金的良好記錄,本次公開征集不接受個人申請及單位聯合申報或項目分包。
2. 申請單位信用管理良好,過去三年無不良記錄。
3. 申請單位必須擁有(自有)運行良好的專業測序設備以滿足三代測序要求,其中通量高、數據產出量大的儀器優先考慮;同時參與該項目的試驗人員和信息分析人員,均應具有相應的專業教育學歷、專業技術知識培訓以及較豐富的業務工作經驗,提供相關學歷或發表文章等文件復印件。發表過CNS(cell,nature,science)或者影響因子不低于nature genetics水平的SCI文章則可優先考慮。(注:須提供包含投標人單位人員參與發表文章的首頁并蓋章。)
4. 申請單位需提供質量管理體系認證、職業健康安全管理體系認證、環境管理體系認證相關材料。
二、采購內容及預算
1、采購需求:水體污染物環境效應評估項目全基因組甲基化測序。
2、采購預算:7萬元(人民幣)
3、服務時間:合同約定。
4、付款比例:以實際產生的測序費用為準。
申報單位于2020年12月31日前提交申報書及其附件(蓋章原件一式五份,密封袋裝后郵寄給本公示中聯系人),營業執照等相關材料復印件,逾期不予受理。南京所將根據相關規定,按照“公平、公正、公開”的原則組織評審,擇優確定項目承擔單位。測序內容及樣品數量要求詳見下表1。
表1 本項目內容及樣品數量
序號
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內容
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樣品數量
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1
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全基因組甲基化測序
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15
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2
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測序數據分析:
(1)測序數據質量評估及統計:測序質量值分布統計;測序數據產出統計;
(2) 與參考基因組比對分析;
(3) 全基因組內甲基化位點鑒定和深度統計;
(4) 甲基化5mC和6mA位點的比例統計;
(5) 全基因組甲基化位點區域分布;
(6) 不同類型5mC和6mA的甲基化水平分析;
(7) 全基因組內DNA甲基化圖譜繪制;
(8) 不同基因功能區域內的甲基化水平統計;
(9) repeat區域及上下游的甲基化水平分布;
(10) CpG島區域及上下游的甲基化水平分布;
(11) 5mC位點序列特征分析,6mA 位點motif分析;
(12) 樣品間相關性分析;
(13) 聚類分析;
(14) PCA分析;
(15) 樣品間差異甲基化位點分析;
(16) 差異甲基化位點注釋基因的GO注釋,KEGG注釋,富集分析等;
(17) 樣品間差異甲基化區域分析:差異甲基化區域關聯基因的GO注釋,KEGG注釋,富集分析等
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15
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三、投標截止時間及投標郵寄地址
1、投標截止時間:2020年12月31日下午17時整。
2、投標郵遞地址:生態環境部南京環境科學研究所(江蘇省南京市蔣王廟街8號)。
3、投標文件一式五份,密封裝袋后郵寄給本公示中聯系人,否則作為不符合投標要求文件處理。
4、本次投標結果直接在本所網站上公示,不再直接通知投標單位評審結果,投標單位自行查詢。
四、聯系方式
采購人:生態環境部南京環境科學研究所
聯 系 人:張靜
聯系電話:025-85287093
地 址:生態環境部南京環境科學研究所(江蘇省南京市蔣王廟街8號)
附件1_申報指南.doc
附件2_申請函.doc
附件3_申報書.doc
生態環境部南京環境科學研究所
2020年12月24日