土壤污染防治學科始建于1978年，經過近四十年不斷發展與完善，已成為生態環境部科技創新體系建設的重要學科之一。2008年建立“國家環境保護土壤環境管理與污染控制重點實驗室”。2011年成立土壤污染防治研究中心，其主要職責是：針對我國土壤環境問題，瞄準國家環境戰略需求和國際土壤環境科學發展前沿，以改善土壤環境質量和保障土壤環境安全為核心，開展土壤環境管理與污染控制相關的前瞻性和戰略性的理論與應用技術研究。

目前共有土壤環境基準與標準、區域土壤環境安全、污染地塊風險管控與修復、土壤與地下水污染防治、企業用地土壤環境管理5個學科方向。

中心擁有國內頂尖的專業研究團隊，其中生態環境部創新體系土壤污染防治學科首席專家、高等法院環境資源審判咨詢專家、享受國務院政府特殊津貼1人，生態環境保護青年拔尖人才3名，江蘇省“333”人才1名。2021年土壤中心總人數70人，正式在崗在冊52人，退休返聘1人，長期項目聘任27人。其中研究員6人，副研究員13人，高級工程師2人。博士37人，碩士31人。專業結構全面合理，主要包括：土壤學、環境科學、環境工程、化學、生物學、生態學、水文學、地質學、大氣環境、地理學、環境模擬、大地測量、農業資源利用等。

近年來，中心參與研究制定多項土壤政策法規、標準規范，包括土壤環境質量標準、場地環境保護系列標準等；業務范圍包括：污染場地調查評估與修復、污染農田調查評估與修復、地下水污染防治、在產企業地塊污染防治、土壤環境信息技術、修復材料與設備研發等；主持/參與各類科研項目多項，包括國家重點研發、“973”、“863”、科研支撐、自然基金、重點研發計劃、環保公益科研專項以及其他省部委環?？蒲许椖康?。獲省部級及其他科技獎項20余項，發表文章140余篇，國家專利60余項。